More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13833 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  100 
 
 
443 aa  904    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  32.08 
 
 
666 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 
704 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  30.06 
 
 
609 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  42.99 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  38.26 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  26.52 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  33.05 
 
 
146 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  35.09 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  37 
 
 
613 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  32.52 
 
 
143 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
155 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 
145 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 
145 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  31.3 
 
 
188 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35.71 
 
 
140 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  40.7 
 
 
142 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  34 
 
 
146 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  36.89 
 
 
310 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.86 
 
 
145 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 
618 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
148 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.76 
 
 
140 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
639 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  33.59 
 
 
153 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  42.68 
 
 
144 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  32 
 
 
146 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  32.82 
 
 
153 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  29.01 
 
 
146 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.58 
 
 
615 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  31.58 
 
 
615 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
144 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.58 
 
 
615 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  32.06 
 
 
153 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.36 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  33.94 
 
 
339 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
149 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.06 
 
 
153 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  37 
 
 
156 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
615 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.73 
 
 
145 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
618 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  34.21 
 
 
614 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
615 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  41.46 
 
 
131 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
286 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  31.3 
 
 
153 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  39.36 
 
 
351 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
1344 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  31.3 
 
 
153 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 
145 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  31.3 
 
 
153 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
615 aa  60.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  33.06 
 
 
158 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
620 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32 
 
 
146 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.37 
 
 
125 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  24.23 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 
143 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  30.7 
 
 
648 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
620 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
620 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
620 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 
136 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1428 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 
141 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
615 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  33.33 
 
 
143 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  33.94 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  30.58 
 
 
146 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  32.79 
 
 
317 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  30.56 
 
 
606 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
143 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
606 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  31.93 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  40.96 
 
 
280 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  31.93 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  31.93 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
137 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
153 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4064  KpsF/GutQ family protein  38.37 
 
 
348 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  25.78 
 
 
150 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
140 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
143 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  27.07 
 
 
144 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.82 
 
 
142 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 
145 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  28.16 
 
 
140 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 
185 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 
603 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  35.19 
 
 
310 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>