More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3160 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3160  CBS domain containing protein  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  39.46 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  43.64 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  39.82 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  36.75 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.45 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.19 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  34.65 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  34.88 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.04 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  29.32 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.61 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.06 
 
 		 517 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.59 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.89 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  30.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  37.37 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 618 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 517 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 486 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.74 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  32.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  30.3 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  31.86 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.45 
 
 		 517 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.45 
 
 		 517 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.45 
 
 		 517 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  29.01 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.7 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.41 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  30.84 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  30.88 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  34.65 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  36.7 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30.3 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.02 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  33.67 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  32.71 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  29.91 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  32.73 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  28.91 
 
 		 865 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 510 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 574 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>