More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0824 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
143 aa  276  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  58.74 
 
 
143 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  57.04 
 
 
142 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  58.45 
 
 
142 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  55.24 
 
 
142 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  57.34 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  61.9 
 
 
142 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  53.85 
 
 
143 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  54.61 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  51.41 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  46.15 
 
 
143 aa  120  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  43.36 
 
 
143 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  48.25 
 
 
177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  46.85 
 
 
143 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  44.76 
 
 
144 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  44.76 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.39 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  44.44 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  45.39 
 
 
143 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  45.39 
 
 
143 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  43.28 
 
 
142 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  40.56 
 
 
142 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  43.06 
 
 
143 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  43.26 
 
 
143 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  39.01 
 
 
142 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  44.06 
 
 
142 aa  103  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3505  signal-transduction protein  53.9 
 
 
142 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3577  signal-transduction protein  53.9 
 
 
142 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3517  signal-transduction protein  53.9 
 
 
142 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  44.37 
 
 
142 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  38.19 
 
 
144 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  42.65 
 
 
145 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  41.61 
 
 
170 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  48.41 
 
 
144 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  43.18 
 
 
144 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  42.66 
 
 
143 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  42.42 
 
 
144 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  41.55 
 
 
142 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  40.56 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  39.86 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  40.85 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  38.3 
 
 
143 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  36.36 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  41.55 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.19 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.46 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  42.76 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 
145 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  38.69 
 
 
142 aa  87  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  36.17 
 
 
163 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  39.72 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  40 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  40 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.25 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.41 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  38.57 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  37.86 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  38.24 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  38.57 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  35.25 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  35.46 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  37.86 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  39.06 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35.92 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  34.59 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  35.82 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  31.69 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  32.62 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  32.62 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.12 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  31.69 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  35.71 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.91 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  32.62 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  31.69 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  33.57 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2688  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  27.46 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>