More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3011 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
148 aa  290  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  42.45 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  45.38 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  34.53 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  38.61 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  40.4 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.96 
 
 
837 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.19 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  32.76 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  27.87 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.86 
 
 
188 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.85 
 
 
840 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  38.26 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.4 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  34.65 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.46 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  34.26 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  23.39 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  34.29 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  35.54 
 
 
314 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.61 
 
 
606 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.66 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32.48 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.7 
 
 
282 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35.34 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.73 
 
 
262 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  34.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.01 
 
 
688 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0893  putative signal transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.592016  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
211 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  33 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  31.62 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.04 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  42.34 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  36.21 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36.36 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
689 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.43 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
291 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.36 
 
 
865 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.04 
 
 
688 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  30.51 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  26.32 
 
 
282 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  38.26 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  37.23 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  34.55 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.4 
 
 
281 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.76 
 
 
571 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.43 
 
 
279 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  31.3 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.26 
 
 
637 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.8 
 
 
855 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  32.38 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.43 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.04 
 
 
1560 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  28.23 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  31.3 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  32.69 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.43 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  39.33 
 
 
636 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 
885 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 
873 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2181  putative sigma54 specific transcriptional regulator  26.36 
 
 
594 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000200827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  28.1 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  30.25 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  32.33 
 
 
629 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  32.69 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  31.21 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
767 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.25 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>