More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2858 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
125 aa  246  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  60 
 
 
124 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  53.39 
 
 
134 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  35.59 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  35.59 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  35.77 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  36.04 
 
 
601 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.84 
 
 
613 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  33.05 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  31.09 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  38.38 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.2 
 
 
596 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.36 
 
 
596 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.61 
 
 
185 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
598 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
618 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
624 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
623 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.41 
 
 
615 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  37.7 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  34.43 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.41 
 
 
615 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
603 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
907 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.9 
 
 
867 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
615 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
623 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
207 aa  57.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 
608 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  34.45 
 
 
877 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  28.57 
 
 
615 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.3 
 
 
614 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 
432 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
903 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  31.15 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30 
 
 
606 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
606 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  29.92 
 
 
637 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.58 
 
 
603 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  31.5 
 
 
629 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
212 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 
615 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
620 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  31.48 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
603 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.75 
 
 
492 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  36.67 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.58 
 
 
603 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.9 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
903 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  33.61 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  34 
 
 
314 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.43 
 
 
605 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
903 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.57 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  32.23 
 
 
626 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 
615 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  30.33 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  34.45 
 
 
907 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  51.92 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.21 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.51 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 
480 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  33.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  30 
 
 
281 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  35.85 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  33.91 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.45 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  27.2 
 
 
135 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  25.83 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.51 
 
 
769 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.75 
 
 
282 aa  52  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 
615 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>