More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4551 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 154 aa  303  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 154 aa  303  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  51.95 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  50.33 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.27 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  46.27 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  40.65 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  43.2 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  39.84 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  41.09 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  39.17 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  32.41 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  40.74 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  40.5 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  38.19 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  37.24 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.97 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.44 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  35.25 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  38.84 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  38.89 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.17 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.78 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 625 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.56 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.57 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  34.59 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  36.07 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  37.86 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  26.45 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.67 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  39.64 
 
 		 606 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.84 
 
 		 586 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.23 
 
 		 589 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.5 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  35.85 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.5 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  32.5 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  37.38 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  28.91 
 
 		 629 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  36.19 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  29.08 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.14 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.85 
 
 		 605 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>