More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0896 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  60 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  53.85 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.88 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 185 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  45.38 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  38.79 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  37.19 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35.96 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  29.84 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 623 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 618 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  34.19 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  37.07 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 769 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.9 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 623 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  38 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 		 625 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 615 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.58 
 
 		 615 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 624 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.88 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  29.91 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  29.06 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  29.06 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  37.5 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  36.36 
 
 		 503 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 620 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 641 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  36.28 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.75 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  28.93 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  39.83 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 620 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 620 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  39.83 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  38.38 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  33.91 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  33.62 
 
 		 880 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.03 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.17 
 
 		 613 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  36.36 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  32.54 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.43 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  35.9 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.43 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 620 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.21 
 
 		 903 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.2 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  34.19 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  31.2 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  31.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  34.48 
 
 		 606 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  30.3 
 
 		 637 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>