More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0766 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 
215 aa  89.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
215 aa  86.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  27.42 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  25.39 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.99 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.75 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.88 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  35.07 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.18 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.35 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  25.11 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.3 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.34 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.54 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  32.59 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  32.84 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  32.84 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.51 
 
 
216 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  33.08 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.5 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  28.99 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.53 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.05 
 
 
139 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
142 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  23.91 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.65 
 
 
313 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
162 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  34.96 
 
 
124 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  35.48 
 
 
129 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.08 
 
 
148 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  34.13 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.33 
 
 
132 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.24 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.82 
 
 
153 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  22.99 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.43 
 
 
139 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.97 
 
 
873 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  29.71 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  22.81 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  22.61 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  22.67 
 
 
380 aa  62.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 
1274 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 
885 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  24.12 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.43 
 
 
139 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  29.23 
 
 
399 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  33.33 
 
 
137 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  28.69 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
208 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  37.8 
 
 
865 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32.84 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.68 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.89 
 
 
152 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  30 
 
 
141 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.77 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  30 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
867 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
139 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30 
 
 
139 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  29.03 
 
 
154 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.14 
 
 
145 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  23.14 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
139 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  32.23 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
145 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.34 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  27.08 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.52 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  28.79 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  32.89 
 
 
375 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  29.66 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  28.97 
 
 
348 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5660  hypothetical protein  26.53 
 
 
839 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.77 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.77 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  29.84 
 
 
413 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
845 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>