More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1100 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  100 
 
 		 152 aa  292  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  77.69 
 
 		 122 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  65.57 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  63.03 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  61.9 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  60.63 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  62.1 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  53.72 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  45.54 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.9 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  37.96 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.03 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36.45 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  42.72 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  40.86 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  41.9 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.33 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.39 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  37.96 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.19 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  40.43 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  35.19 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  38.53 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  34.95 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  47.13 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  41.18 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  35.4 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  44.09 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.17 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  38.1 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  33.94 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 643 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.01 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  34.55 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  38.61 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 634 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  39.42 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.42 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  32.58 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.67 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  31.19 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  37.5 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  30.89 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.86 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  30.17 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.15 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  32 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  36.45 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  30.95 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  36.7 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  37.86 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>