More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0173 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  100 
 
 
130 aa  253  8e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  81.89 
 
 
127 aa  220  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  70.08 
 
 
127 aa  204  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  71.09 
 
 
128 aa  191  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  50 
 
 
688 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  41.27 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 
688 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.52 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  47.87 
 
 
688 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  42.06 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  42.55 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  38.98 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  41.51 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  42.98 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  43.09 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  38.14 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  46.28 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.17 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  39.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  41.23 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.74 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  39.5 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
643 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.14 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  43.16 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  41.53 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  34.19 
 
 
646 aa  73.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  40.34 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  41.23 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.13 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  44.9 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.05 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  42.55 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  34.51 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  34.4 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  37.1 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  43.27 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  42 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  36.13 
 
 
646 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  44.34 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.29 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  41.05 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  44.09 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.45 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  39.8 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  35.54 
 
 
645 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  37.7 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  38.46 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  37.07 
 
 
638 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  35.54 
 
 
641 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.84 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  35.29 
 
 
622 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36.44 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  39.47 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.29 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  35.48 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  35.88 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  40 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  35.14 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  35.04 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  32.58 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.37 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35.71 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  38.66 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  37.04 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  45.36 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  28.1 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  39.42 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.25 
 
 
605 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.36 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  35.54 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  37.04 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  38.14 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 
629 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  28.46 
 
 
614 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.6 
 
 
648 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  34.51 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  36.07 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  34.45 
 
 
644 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  33.33 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.43 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  43.88 
 
 
574 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.61 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.78 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  40.86 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  34.74 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 
615 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  41.51 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  37.17 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>