More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2400 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  40.38 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  36.54 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  39.42 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2330  signal-transduction protein  37.98 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.51 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  38.32 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  38.02 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  34.55 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.73 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  34.74 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  34.75 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  29.91 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.88 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  29.41 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  31.36 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  26.72 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  32.38 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.42 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  26.45 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  32.76 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  29.06 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  33.05 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  35.63 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  26.89 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  35.85 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.31 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28.8 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  31.9 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  26.79 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  26.23 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  29.06 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  23.73 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  24.79 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.05 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  25.64 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  28.28 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  29.2 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.58 
 
 		 489 aa  53.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.221976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>