More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0663 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  100 
 
 		 127 aa  250  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  76.38 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  81.89 
 
 		 130 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  71.88 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  47.87 
 
 		 688 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  38.58 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 688 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 688 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  39.29 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  39.83 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 623 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  39.62 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  38.71 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  42.24 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  39.84 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.79 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  33.9 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  40.38 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.1 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  42.55 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  41.74 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  44.95 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  44.86 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  37.61 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  37.82 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  36.29 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  36.29 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  35.45 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  34.82 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  37.6 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  41.07 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  38.79 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 		 643 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  44.94 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  40.18 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  40.86 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.09 
 
 		 614 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  38.18 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  40.83 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  40 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  33.08 
 
 		 629 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.91 
 
 		 605 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  32.74 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 618 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  30.71 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.57 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  36 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  33.02 
 
 		 646 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  41.51 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  35.71 
 
 		 502 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 639 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.89 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.23 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  30.65 
 
 		 315 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>