More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5727 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  57.98 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  50 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  37.76 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  38.35 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  34.85 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  42.57 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  40.4 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36.7 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  40.19 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  43.48 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.55 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  37.89 
 
 		 666 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  37.4 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.71 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  30 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  32.74 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  32.38 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.56 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  28.21 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 603 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  31.73 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  33.91 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  30.36 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  39.39 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  29.91 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  36.27 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  30.23 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 286 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 618 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  34.35 
 
 		 637 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  32.38 
 
 		 624 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  38.1 
 
 		 443 aa  61.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  35.05 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  30 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  28.23 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  30.97 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 606 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  25.45 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  29.01 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 606 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  25.74 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  31.19 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3160  CBS domain containing protein  33.9 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  31.4 
 
 		 606 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  32.65 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.84 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  35 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  24.55 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  30.23 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.66 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  32.2 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.52 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  31.86 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  35.24 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  40 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.67 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 		 688 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>