More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1425 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  100 
 
 		 144 aa  278  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  42.75 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  44.07 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  40.34 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  41.54 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  42.02 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  40.35 
 
 		 688 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  39.82 
 
 		 688 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  40.87 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.13 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  40.87 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  36.84 
 
 		 629 aa  77.4  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.34 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  40 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.79 
 
 		 613 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 		 688 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  39.47 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  35.56 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  40.48 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  41.07 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  36.15 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.51 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  41.67 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.76 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  41.58 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 		 625 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  34.86 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 618 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.59 
 
 		 606 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  38.74 
 
 		 637 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  44.94 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.07 
 
 		 1560 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  40.45 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  34.45 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  36.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.1 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  34.45 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  35.85 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  38.32 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 618 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 638 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  36.67 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  38.79 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  34.78 
 
 		 646 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  40.19 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  35.38 
 
 		 644 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.54 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  37.74 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  40.18 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.87 
 
 		 633 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 627 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  37.39 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  29.84 
 
 		 626 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.63 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 663 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.82 
 
 		 486 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>