More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0239 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  100 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  68.5 
 
 		 132 aa  179  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  42.24 
 
 		 688 aa  100  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  45 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  42.24 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  44.26 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  41.38 
 
 		 688 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  45.3 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  44.35 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  41.32 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  48.45 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  42.61 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.66 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  43.14 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.96 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  39.2 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  40.5 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.39 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 688 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  38.66 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  39.66 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  38.74 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.52 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  36.8 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.34 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.52 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.15 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  35.4 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  38.26 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  39.66 
 
 		 217 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  33.33 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  34.15 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.48 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.19 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  37.8 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  35.83 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  33.62 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 215 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  37.89 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>