More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0633 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  70.92 
 
 
141 aa  214  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  67.38 
 
 
141 aa  207  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  66.43 
 
 
141 aa  204  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  51.97 
 
 
145 aa  138  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  49.21 
 
 
145 aa  130  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  47.66 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  47.33 
 
 
136 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  48.46 
 
 
145 aa  125  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  48.46 
 
 
142 aa  124  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  45.19 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  40 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.86 
 
 
130 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  46.3 
 
 
136 aa  100  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  47.66 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.45 
 
 
135 aa  94  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  48.7 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  41.03 
 
 
688 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  40.3 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
688 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.84 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  43.36 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.5 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.16 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  39.81 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  35.82 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  35.88 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  37.31 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  36.13 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  42.74 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  43.24 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  41.44 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
688 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  38.02 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  42.55 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  45.26 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.14 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  35.45 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  37.96 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.06 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  40.54 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  36.45 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  30.15 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  33.62 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  34.48 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  33.9 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.51 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  34.78 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
837 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  34.58 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  28.06 
 
 
626 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 
625 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  35.85 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  34.82 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  36.54 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.59 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.61 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  32.59 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  35.58 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  34.26 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  28.23 
 
 
627 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
618 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  28.33 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.15 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  31.4 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  31.78 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  29.41 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.82 
 
 
626 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  28.93 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
625 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  33.06 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
624 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.81 
 
 
641 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  34 
 
 
689 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  28.07 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  29.41 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  31.48 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  33.65 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  24.79 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  36.27 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>