More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0188 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  100 
 
 		 128 aa  253  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  68.75 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  71.88 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  71.09 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.28 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  44.04 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  43.12 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  36.07 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  41.09 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  41.28 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  41.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  38.98 
 
 		 646 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  44.68 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  41.51 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  40 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  39.83 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  43.62 
 
 		 688 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  44.12 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  36.44 
 
 		 622 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  40.35 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  40.38 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  46.23 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  35.14 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.53 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  42.11 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 645 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.13 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  35.59 
 
 		 644 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  36.54 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  42.59 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  40.82 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  44.55 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  45.26 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  41.51 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 645 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 645 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  37.89 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 645 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.85 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  41.28 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 		 643 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  39.64 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.13 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.56 
 
 		 331 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  32.82 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.25 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  36.45 
 
 		 645 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  38.1 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 646 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  39.09 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  37.04 
 
 		 638 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  31.86 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  33.06 
 
 		 315 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 623 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35 
 
 		 606 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  40.43 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  37 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  36.19 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 		 639 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  36.19 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.75 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.48 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  38.14 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 618 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  38.38 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  35.2 
 
 		 344 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>