More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0628 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  100 
 
 
141 aa  279  7.000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  70.92 
 
 
141 aa  219  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  67.38 
 
 
141 aa  207  4e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  68.09 
 
 
141 aa  205  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  54.55 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  52.8 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  52.27 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  51.67 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  47.66 
 
 
142 aa  117  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  46.67 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  44.44 
 
 
160 aa  114  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  47.5 
 
 
142 aa  114  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  50.39 
 
 
138 aa  100  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  42.11 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  41.01 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  40.34 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  46.3 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.74 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.69 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  39.55 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.9 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  37.5 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.62 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  35.48 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.9 
 
 
688 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  39.32 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
688 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
688 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  35.65 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  46.15 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.2 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  44.23 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  36.97 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  37.84 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.9 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  36.03 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
643 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  37.84 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  38.79 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.79 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  39.64 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  44.32 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.28 
 
 
177 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.29 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  37.61 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  37.14 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.21 
 
 
625 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.51 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.61 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  30.77 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  28.93 
 
 
626 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
618 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34.91 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.91 
 
 
837 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  34.82 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  38.39 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  38.53 
 
 
152 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.75 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.37 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.91 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  37.38 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.68 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.62 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  35.71 
 
 
187 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  35.96 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  36.13 
 
 
646 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  37.72 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1344 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.4 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  37.38 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  35.19 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  31.15 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  27.19 
 
 
639 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  31.25 
 
 
629 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 
321 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 
321 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.66 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.38 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  30.25 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  30.09 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  36.51 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  33.93 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
639 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  30.7 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  32.59 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>