More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3204 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
139 aa  274  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  99.28 
 
 
139 aa  272  9e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  98.56 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  71.22 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  56.12 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  52.52 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1679  putative signal-transduction protein with CBS domains  56.12 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0332032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1750  putative signal transduction protein with CBS domains  56.12 
 
 
160 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0985787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  35.88 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  38.33 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  35.11 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  34.38 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  40.54 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  34.13 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.88 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  35.88 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  33.59 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  38.33 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.11 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  41.07 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  34.35 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  34.35 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35.29 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  34.35 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  34.35 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.71 
 
 
688 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  36.13 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  34.17 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
688 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
688 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  32.17 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.82 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  35.65 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  33.59 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  39.6 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  37.25 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  40.35 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  37.01 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  36.61 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.19 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.98 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  35.94 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  33.59 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  36.75 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 
615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  28.79 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  37.01 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  39.64 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  34.45 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  29.69 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.61 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  32.28 
 
 
626 aa  67  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  36.07 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  37.5 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
618 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.45 
 
 
605 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.5 
 
 
626 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  32.31 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  35.16 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  42.72 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  33.88 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  31.91 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  34.82 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
615 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  31.09 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  28.1 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  35.29 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  35.59 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.19 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  26.56 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.65 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  30.95 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 
170 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>