More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0620 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  100 
 
 
144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  94.44 
 
 
144 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  46.27 
 
 
139 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  45.86 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  42.97 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  44.54 
 
 
141 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  40.65 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  42.62 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  44.12 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  39.71 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  38.35 
 
 
141 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  42.02 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  42.5 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  38.41 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  42.86 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.5 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  41.6 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  42.31 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.96 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  36.97 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.97 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
688 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.57 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  37.19 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.13 
 
 
688 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  39.52 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  39.5 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.75 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.52 
 
 
648 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  46.15 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.21 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 
663 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.05 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
688 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  38.02 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  36.75 
 
 
629 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  34.48 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.52 
 
 
498 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  35.77 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  35.25 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  36.29 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  35.9 
 
 
645 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  40.87 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  41.75 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  33.9 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  41.75 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.75 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  32.48 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32.48 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.15 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.13 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  36.07 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
643 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.58 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  34.19 
 
 
622 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 
645 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  42.11 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3089  sensory box protein  29.84 
 
 
858 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  31.53 
 
 
646 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.82 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
645 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  37.31 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
644 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  36.61 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  32.48 
 
 
646 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  31.62 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  32.76 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  34.29 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  31.62 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
618 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.03 
 
 
637 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.31 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 
689 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  32.38 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.38 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  33.9 
 
 
481 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
225 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.75 
 
 
626 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  34.62 
 
 
634 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  42.47 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  38.24 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  34.4 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  32.11 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.45 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.79 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>