More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0583 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  293  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  45.64 
 
 
149 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  51.39 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  54.05 
 
 
149 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  43.62 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  44.67 
 
 
150 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
291 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  42.67 
 
 
150 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  41.89 
 
 
211 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  43.62 
 
 
153 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  42.95 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  41.22 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  36.73 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  37.41 
 
 
150 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  41.89 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.69 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  38.93 
 
 
162 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  39.46 
 
 
150 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  38.3 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  37.58 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  41.22 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.86 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  42.86 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
478 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  39.2 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  35.42 
 
 
154 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  37.74 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.6 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  39.2 
 
 
480 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.29 
 
 
185 aa  77  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  34.81 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.89 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.51 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.48 
 
 
606 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.83 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.82 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.52 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  33.1 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  35 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.71 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  35.07 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.43 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  37.1 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  38.06 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.54 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  31.16 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.61 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  33.33 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 
605 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.96 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  40.38 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.51 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 
615 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  42.39 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.2 
 
 
664 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.6 
 
 
485 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  30.47 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.11 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.59 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  37.93 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  35.07 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  29.77 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.21 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  31.3 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.33 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.58 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.36 
 
 
613 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 
207 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.82 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  40 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.58 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
598 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.44 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  34.06 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  34.4 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.17 
 
 
589 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
286 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>