More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2011 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  40.18 
 
 
142 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  40 
 
 
142 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.97 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  38.76 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  40.4 
 
 
141 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 
139 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.09 
 
 
147 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.81 
 
 
139 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.2 
 
 
140 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  40 
 
 
139 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  40 
 
 
139 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.96 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  38.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  38.33 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  41.9 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  45.71 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  33.33 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 
140 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.09 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.26 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  39.45 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  36.44 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  33.04 
 
 
148 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 
141 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.58 
 
 
615 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.33 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  31.25 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  34.58 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  34.58 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 
618 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  35.4 
 
 
142 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.73 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  34.58 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  35.14 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  30.71 
 
 
149 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  32.52 
 
 
146 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.24 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  33.33 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  31.07 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  31.47 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  33 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  31.62 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  31.43 
 
 
144 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
615 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
615 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  36.11 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  33.33 
 
 
666 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  32.39 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  37 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  37.38 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  34.02 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
609 aa  65.9  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.38 
 
 
142 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  31.47 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  31.34 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  37 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.58 
 
 
150 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  31.82 
 
 
164 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
143 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
147 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  27.4 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
143 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
620 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 
142 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
149 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.34 
 
 
138 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 
620 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
145 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
620 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
620 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 
615 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  27.93 
 
 
207 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  35.45 
 
 
139 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  29.63 
 
 
133 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  34.19 
 
 
146 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  31.13 
 
 
145 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
145 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
211 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  31.48 
 
 
147 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>