More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1528 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  100 
 
 		 153 aa  295  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  87.58 
 
 		 153 aa  266  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  42.95 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  41.67 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  44.72 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 211 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  41.38 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  42.57 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  36.91 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  39.01 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  39.84 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.84 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  38.4 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.67 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  37.3 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  36.64 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  32.39 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  40.71 
 
 		 480 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.81 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  32.64 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.64 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  36.19 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  37.88 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  34.62 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  31.16 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  28.03 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.43 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.09 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.08 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  35.59 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1274 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  32.19 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.51 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  37.29 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  35.59 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  32.88 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.12 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  29.71 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.85 
 
 		 589 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 605 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  30.82 
 
 		 629 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  26.81 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  37.9 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.48 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  28.99 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1344 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  31.71 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  30.97 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  42.34 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.25 
 
 		 626 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  28.35 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 		 376 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  28.07 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.27 
 
 		 627 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>