More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1150 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1150  CBS  100 
 
 
154 aa  306  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  51.95 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  51.95 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  47.4 
 
 
154 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.87 
 
 
155 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  39.87 
 
 
155 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  41.13 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  37.58 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  39.72 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  39.01 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  38.19 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
211 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  36.81 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 
291 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  40.16 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  34.15 
 
 
625 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  36.92 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  35.88 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  34.43 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  36.11 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  41.41 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.23 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  36.05 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.89 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40.91 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  35 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
478 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.04 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  40.95 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.87 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.67 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.84 
 
 
627 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.01 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.3 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.8 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
618 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.25 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
613 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  29.51 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.1 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  32.65 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  32.26 
 
 
626 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  33.59 
 
 
628 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  25.83 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  30.83 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.58 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  30.97 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.63 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.02 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.58 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  30.97 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.55 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  31.15 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  31.4 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  26.12 
 
 
207 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.67 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.71 
 
 
626 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.2 
 
 
626 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  36.89 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  30.83 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
615 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  32.79 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  31.53 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>