More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1388 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  50.68 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  54.05 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  46.9 
 
 		 211 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  45.27 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  46.21 
 
 		 291 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  42.28 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  42.95 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  41.38 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  43.88 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.22 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  44.92 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  41.84 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  37.84 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  38.19 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  41.59 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.09 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  41.09 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.32 
 
 		 478 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  42.86 
 
 		 480 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  41.6 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  34.03 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 188 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  41.12 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  40.16 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  37.23 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.1 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  38.14 
 
 		 601 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.51 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  34.04 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  39.02 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.25 
 
 		 606 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  44.68 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.07 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.81 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.81 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  34.92 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  35.65 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  37.19 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  37.69 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.15 
 
 		 664 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  33.83 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  32 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  36.29 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.6 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  26.92 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>