More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3679 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  100 
 
 		 150 aa  286  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  70 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  69.13 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  41.22 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  42.57 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  44.88 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  45.59 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  46.88 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  41.78 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.03 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  43.26 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.04 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  41.13 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.27 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.09 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.62 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.29 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.34 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  39.34 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  45.05 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.22 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  41 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  40.95 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  36.13 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.07 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  41.18 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 485 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  34.86 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  40.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.24 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.31 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  39.05 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  35.77 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  34.07 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  28.99 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1274 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  37.5 
 
 		 614 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  36.8 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  39.32 
 
 		 393 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.88 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.3 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  34.88 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.21 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  28.57 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  39.17 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 		 489 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  27.34 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  37.84 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.97 
 
 		 488 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>