More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3080 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
145 aa  280  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  45.26 
 
 
141 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  40.88 
 
 
143 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
144 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  40.46 
 
 
139 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  40.44 
 
 
142 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  46.72 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  43.85 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  40.28 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.98 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  38.64 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.26 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  36.89 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  40.83 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  38.33 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.5 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  37.5 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  36.67 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.63 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  36.67 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.63 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  40.6 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  35.2 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.04 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  35.2 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35 
 
 
688 aa  70.5  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.36 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34.17 
 
 
688 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.61 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.59 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  38.02 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  35.2 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  31.94 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  31.69 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  33.09 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 
624 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.41 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  32.19 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  35 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  28.81 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.77 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  34.68 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  32.88 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.64 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.33 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.54 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  34.13 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  25.85 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  39.67 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.14 
 
 
242 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
232 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
211 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
291 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.82 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  27.78 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>