More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3889 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  46.34 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  42.58 
 
 
223 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  36.57 
 
 
230 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  35.05 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  41.67 
 
 
243 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.97 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  40.28 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  38.93 
 
 
242 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  36.81 
 
 
242 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  35.9 
 
 
247 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.07 
 
 
230 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.64 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  37.5 
 
 
242 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.35 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 
147 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  39.63 
 
 
348 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.08 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  35.86 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.6 
 
 
339 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.74 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 
149 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
153 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 
132 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  45.33 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.23 
 
 
226 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.3 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  31.79 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36 
 
 
339 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.03 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  37.06 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.69 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.05 
 
 
338 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.17 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.1 
 
 
152 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  37.11 
 
 
160 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.28 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.88 
 
 
426 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.58 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  24.88 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.25 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  35.33 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.82 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.45 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.38 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.3 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.88 
 
 
282 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.35 
 
 
877 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  30.73 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.81 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.41 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.84 
 
 
142 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.35 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.85 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.82 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.14 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.43 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.88 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.69 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.51 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  36.24 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.56 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.7 
 
 
164 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 
873 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.64 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.03 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.82 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  31.82 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.07 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>