More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2229 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  63.46 
 
 
313 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  58.01 
 
 
315 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  56.18 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  47.31 
 
 
291 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  42.18 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  40.79 
 
 
331 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
315 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 
279 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  37.83 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 
279 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 
279 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
280 aa  125  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.08 
 
 
281 aa  119  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.52 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.16 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.5 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.69 
 
 
427 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  28.52 
 
 
238 aa  86.3  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  32.31 
 
 
258 aa  85.9  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 
427 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.32 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.37 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.76 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  27.96 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
873 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.16 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  36.51 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.59 
 
 
867 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  38.61 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  32.52 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.85 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.04 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.26 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.23 
 
 
769 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  32.09 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  34.68 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  24.2 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  33.94 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  32.61 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  28.25 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  25.1 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.41 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 
877 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  30.16 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.53 
 
 
877 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.69 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  28.85 
 
 
909 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
209 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  32.33 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.94 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  29.78 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  26 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  25.81 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  25.58 
 
 
880 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.3 
 
 
907 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  24.91 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
489 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  33.01 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.05 
 
 
903 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
488 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.09 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  25.39 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30.83 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.27 
 
 
875 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.45 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  23.28 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 
141 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  25.89 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.5 
 
 
688 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.65 
 
 
149 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.56 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0196  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
490 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  24 
 
 
251 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>