More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0706 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  100 
 
 		 144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  52.45 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  53.19 
 
 		 157 aa  153  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  54.79 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  52.48 
 
 		 157 aa  151  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  47.95 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  52.45 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  51.45 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  45.58 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  46.72 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  43.15 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  43.15 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  43.15 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  45.71 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  41.78 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  41.78 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  44.76 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  44.76 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  46.43 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  46.03 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  45 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  45 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  45 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  44.29 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  44.29 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  42.86 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  43.08 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  43.33 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.45 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  45.99 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  40.71 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  38.73 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  37.86 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.07 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  40.43 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  38.52 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  40.58 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  39.13 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  38.78 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  39.13 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  39.86 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  38.41 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  39.13 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.37 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  41.01 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  40.2 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  37.41 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  39.32 
 
 		 193 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  40.43 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  37.68 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  43.8 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  41.48 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  39.73 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.44 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  35.54 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  37.78 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  37.9 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  37.38 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  38.21 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.6 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  37.29 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  37.82 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.04 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  34.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>