More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0446 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  45.38 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  43.7 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  42.15 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  41.54 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  43.38 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.28 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  47.86 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  46.67 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  40.74 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  42.34 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  43.38 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  40.77 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  41.04 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.35 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  42.96 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  45.79 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  44.26 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  41.53 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  42.02 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  40.74 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  41.35 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  41.48 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  37.4 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  40.6 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  37.14 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  41.79 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  41.94 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  39.23 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  40.52 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  38.06 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  41.67 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  38.06 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.17 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  40.6 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  41.18 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  38.93 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.31 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  35.54 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.6 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  36.64 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  42.37 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  45.3 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  36.64 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  39.1 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  42.48 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  43.9 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.48 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  42.48 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  42.5 
 
 		 216 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  40.31 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  40.31 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  40.31 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  36.29 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  40.28 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 625 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.47 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  37.19 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  38.05 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.76 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  42.61 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  35.96 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>