More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4061 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  74.48 
 
 		 170 aa  214  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  58.78 
 
 		 157 aa  147  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  52.45 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  49.32 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  47.95 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  47.59 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  47.59 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  48.97 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  47.59 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  46.21 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  45.77 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  48.55 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  41.84 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  41.43 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  44.29 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  41.13 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  46.4 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  43.66 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  43.66 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  44.92 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  42.96 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  40.32 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.88 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.46 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.16 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  42.25 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  40.31 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  44.17 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  37.32 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  39.02 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.73 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  47.17 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.32 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  36.62 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.62 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  37.78 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  47.11 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  39.83 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  40.98 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  39.83 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  41.03 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.52 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  38.33 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  41.88 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  41.43 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  34.72 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  39.67 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  42.96 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  40.65 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  37.7 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  36.03 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  40.68 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  34.19 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  35.2 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  45 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  38.64 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.61 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  39.02 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>