More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6054 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  39.66 
 
 
144 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 
143 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.51 
 
 
139 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  39.83 
 
 
138 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  37.6 
 
 
139 aa  84.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  39.67 
 
 
141 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.97 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  38.64 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  41.94 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40.34 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  35.25 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.04 
 
 
145 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  40.52 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.58 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.42 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.66 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  35.83 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  37.07 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
143 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  36 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  35.42 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.61 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  31.62 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.91 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.06 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  39.5 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.96 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  37.29 
 
 
141 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.5 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  31.97 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.61 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  40.37 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  32.46 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.43 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  34.19 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  33.87 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 
140 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  36.45 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.37 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  33.87 
 
 
144 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  38.89 
 
 
138 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
146 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  31.67 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  32.48 
 
 
303 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  27.01 
 
 
140 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  37.29 
 
 
139 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  32.46 
 
 
303 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 
151 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.09 
 
 
139 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 
137 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.45 
 
 
143 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.83 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  28.19 
 
 
348 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 
146 aa  61.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>