More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0610 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  100 
 
 		 348 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  58.61 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  57.53 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  57.4 
 
 		 338 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  43.33 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  42.47 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  41.96 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  47.97 
 
 		 230 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  41.07 
 
 		 171 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  40.38 
 
 		 226 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  40.62 
 
 		 230 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  43.92 
 
 		 230 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  44.08 
 
 		 231 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  39.63 
 
 		 217 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  42.68 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  42.04 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  39.22 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  37.14 
 
 		 156 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  41.89 
 
 		 229 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  36.49 
 
 		 243 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  37.21 
 
 		 243 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  37.16 
 
 		 149 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  35.37 
 
 		 242 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  37.72 
 
 		 158 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 		 243 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  43.01 
 
 		 165 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  41.57 
 
 		 165 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.78 
 
 		 242 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  35.37 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  44.83 
 
 		 164 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.81 
 
 		 155 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 232 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  46.34 
 
 		 164 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 		 154 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  33.54 
 
 		 163 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  32.85 
 
 		 155 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.49 
 
 		 249 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  37.84 
 
 		 243 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 145 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 		 147 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  37.91 
 
 		 151 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.24 
 
 		 132 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  37.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 		 226 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  36.91 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.81 
 
 		 149 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.32 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  35.55 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  35.06 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.1 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 		 153 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.99 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  35.9 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  26.39 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  36.42 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.38 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.97 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  33.11 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  35.06 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32.68 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.26 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  39.46 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  42.34 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  33.12 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  35.38 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  35.95 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.51 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.97 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.28 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 640 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.79 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.1 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.5 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  27.7 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  30.13 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.65 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>