20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6910 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  340  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  86.34 
 
 
165 aa  293  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  70.55 
 
 
164 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  69.33 
 
 
164 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  60.13 
 
 
163 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  68.46 
 
 
294 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  47.5 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  48 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  37.58 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  36.24 
 
 
151 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  41.1 
 
 
156 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.88 
 
 
338 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  48.86 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.32 
 
 
332 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  46.24 
 
 
333 aa  97.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  43.68 
 
 
339 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  38.4 
 
 
330 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  43.01 
 
 
348 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  39.45 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.23 
 
 
339 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>