20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5205 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  323  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  51.43 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  35.42 
 
 		 339 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  41.1 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  40.8 
 
 		 332 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  37.93 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.13 
 
 		 339 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  39.6 
 
 		 333 aa  97.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  41.98 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  51.85 
 
 		 171 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  39.36 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  39.82 
 
 		 348 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  41.05 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  49.38 
 
 		 330 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  45.56 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  43.28 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>