20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1567 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  86.34 
 
 
165 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  65.45 
 
 
164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  64.24 
 
 
164 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  59.48 
 
 
163 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  62.42 
 
 
294 aa  186  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  46.25 
 
 
158 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  46.58 
 
 
157 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  44.3 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  36.24 
 
 
151 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.98 
 
 
338 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  40.98 
 
 
333 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  41.98 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  44.94 
 
 
332 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  47.13 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  42.7 
 
 
339 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  45.16 
 
 
158 aa  94  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  41.57 
 
 
348 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  40 
 
 
330 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  37.11 
 
 
339 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>