20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0054 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  338  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  98.17 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  99.32 
 
 		 294 aa  296  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  70.55 
 
 		 165 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  65.45 
 
 		 165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  53.85 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  50.97 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  45.45 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  40.85 
 
 		 332 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  45.22 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  48.75 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.65 
 
 		 338 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  51.22 
 
 		 330 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  48.75 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  44.32 
 
 		 333 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  43.68 
 
 		 339 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  44.83 
 
 		 348 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  52.05 
 
 		 158 aa  90.5  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.22 
 
 		 339 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>