20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2707 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  62.03 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  48 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  48.32 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  46.58 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  44 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  44 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  41.91 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  36.96 
 
 		 332 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.26 
 
 		 338 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.03 
 
 		 333 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  41.05 
 
 		 339 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  41.05 
 
 		 339 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  41.05 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.33 
 
 		 330 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  38.95 
 
 		 348 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  37.31 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>