20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1171 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  333  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  62.03 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  50.97 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  47.5 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  50.32 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  46.25 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  48.94 
 
 		 294 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  39.13 
 
 		 332 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  38.41 
 
 		 330 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  43.64 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.26 
 
 		 338 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.97 
 
 		 333 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  44.21 
 
 		 339 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  43.16 
 
 		 339 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  37.93 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  52.38 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  50.67 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.72 
 
 		 348 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>