More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2521 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  100 
 
 
161 aa  324  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  50.32 
 
 
151 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  47.74 
 
 
150 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 
149 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  34.3 
 
 
234 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 
149 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  36.54 
 
 
230 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.67 
 
 
333 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 
232 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.42 
 
 
229 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.56 
 
 
230 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
241 aa  84  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.56 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.71 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  35.53 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.41 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  36.99 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.76 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  35.53 
 
 
339 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 
338 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.11 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.46 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  34.69 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.92 
 
 
226 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  34.48 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.33 
 
 
246 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.61 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.32 
 
 
427 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  33.97 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.44 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.56 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.85 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.65 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.29 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.72 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.81 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  36.13 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
428 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.38 
 
 
242 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.05 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.13 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.67 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.05 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  35.22 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  34.01 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  30.34 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  27.4 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  30.63 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.21 
 
 
330 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.03 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  33.8 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  33.8 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  33.8 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  28.29 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.56 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  34.72 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.7 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.85 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.93 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  24.66 
 
 
300 aa  65.1  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.32 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  31.72 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.35 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 
391 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>