More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1933 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  64.91 
 
 		 231 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  44.25 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  43.67 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  44.64 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  43.67 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  42.79 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  38.39 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  42.36 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  37.84 
 
 		 242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.57 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  38.57 
 
 		 243 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.29 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  40.81 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  36.32 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  41.21 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.22 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.63 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.18 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  29.15 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.22 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  40.79 
 
 		 339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.5 
 
 		 338 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  37.41 
 
 		 339 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.69 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  30.87 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.05 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.27 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.64 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  28.31 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  34.67 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  26.75 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.08 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.37 
 
 		 133 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.61 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.03 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  32.19 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  35.1 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  26.8 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.45 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  27.08 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.22 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.72 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.95 
 
 		 883 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  28.38 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.35 
 
 		 426 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 431 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.33 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  25.54 
 
 		 907 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  26.49 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.91 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  24.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  29.66 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  29.05 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  29.11 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  25.35 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>