More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1650 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  100 
 
 
218 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  54.38 
 
 
219 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  50 
 
 
222 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  38.64 
 
 
217 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  41.1 
 
 
221 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  40.19 
 
 
227 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  37.27 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  36.36 
 
 
234 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  36.77 
 
 
226 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  38.64 
 
 
213 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  35.53 
 
 
241 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  37.61 
 
 
232 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  35.29 
 
 
339 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.45 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.29 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.29 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.29 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.32 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  32.45 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.19 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.6 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.93 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.8 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
427 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.94 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.92 
 
 
152 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.57 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
149 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
120 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.18 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 
153 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.35 
 
 
133 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.3 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.9 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.58 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  38.82 
 
 
427 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.21 
 
 
338 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.13 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 
132 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.16 
 
 
155 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
139 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.03 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.9 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.2 
 
 
423 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
428 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  33.1 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  28.17 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.76 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  30.46 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  33.74 
 
 
399 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
431 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.33 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  33.78 
 
 
330 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  27.19 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  33.57 
 
 
150 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.74 
 
 
147 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
148 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.27 
 
 
332 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.25 
 
 
150 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  55.56 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.53 
 
 
153 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
187 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  25.15 
 
 
145 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  26.13 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  29.41 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  28.29 
 
 
165 aa  55.1  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  26.7 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.37 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  29.45 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.61 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.42 
 
 
490 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  22.07 
 
 
399 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  30.53 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.73 
 
 
161 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  35.59 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.52 
 
 
143 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.45 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.2 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.19 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  27.32 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  27.32 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  28.15 
 
 
389 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
141 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  27.32 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.87 
 
 
145 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  30.65 
 
 
478 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>