More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4840 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  50.69 
 
 
219 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  50 
 
 
218 aa  194  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.59 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.08 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  38.91 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  40.1 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  37.04 
 
 
228 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  33.92 
 
 
234 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.96 
 
 
232 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  34.74 
 
 
213 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  34.8 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.8 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.8 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.46 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.19 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.82 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.94 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.75 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.32 
 
 
348 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.81 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  30.05 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  25.79 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.29 
 
 
152 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.3 
 
 
154 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  35.54 
 
 
330 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  26.76 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.26 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 
149 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 
149 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  25.82 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 
153 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.33 
 
 
155 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  32.65 
 
 
332 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.92 
 
 
427 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  28.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.57 
 
 
153 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  28.38 
 
 
161 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
449 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
150 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 
148 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.94 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  26.57 
 
 
149 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.33 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.24 
 
 
399 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.14 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  26.05 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 
427 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.41 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  25.87 
 
 
149 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.71 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.17 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 
143 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  34.75 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  24.82 
 
 
143 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.29 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
431 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  27.55 
 
 
215 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 
132 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  24.65 
 
 
411 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.47 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.17 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  30.83 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  27.35 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.84 
 
 
155 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.03 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  24.42 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.62 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 
150 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 
428 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.09 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  29.05 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
154 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 
390 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  24.32 
 
 
155 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  29.08 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.47 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.83 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  31.11 
 
 
389 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  28.39 
 
 
339 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.11 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
120 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  27.46 
 
 
416 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.93 
 
 
128 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  34.58 
 
 
160 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.1 
 
 
145 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  28.91 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  43.64 
 
 
157 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  25 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  27.94 
 
 
243 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
162 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>