More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2260 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  299  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  59.46 
 
 
149 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  59.73 
 
 
149 aa  190  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  61.49 
 
 
149 aa  186  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  53.69 
 
 
149 aa  178  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  53.02 
 
 
149 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  55.03 
 
 
150 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
149 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  37.16 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  40.27 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  38.78 
 
 
152 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 
150 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  37.75 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.91 
 
 
155 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.86 
 
 
149 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
152 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 
150 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
153 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.73 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.46 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  33.33 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  36.49 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  36.49 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  35.66 
 
 
230 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.37 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.57 
 
 
230 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.67 
 
 
348 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  34.27 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.21 
 
 
246 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
230 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  35.21 
 
 
247 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.99 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  33.11 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.56 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  30.67 
 
 
339 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.39 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  33.33 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  36.11 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  35.66 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  36.55 
 
 
426 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.45 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  32.88 
 
 
333 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.25 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 
228 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.76 
 
 
338 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.01 
 
 
233 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
231 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.94 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.52 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.99 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 
628 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.92 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.29 
 
 
423 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  26.35 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  37.41 
 
 
436 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  34.97 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.07 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.45 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 
625 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  38.78 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  34.42 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  29.25 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.07 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  31.61 
 
 
391 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.47 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.77 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  32.41 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.41 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  27.52 
 
 
157 aa  67  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.07 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  30.38 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  28.03 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.19 
 
 
220 aa  66.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
620 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>