More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3779 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  320  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  92.5 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  76.87 
 
 		 154 aa  241  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  39.42 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 256 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  45.71 
 
 		 225 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  38.35 
 
 		 223 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  43.8 
 
 		 216 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  39.69 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  43.07 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  39.55 
 
 		 214 aa  93.6  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  42.54 
 
 		 212 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  41.54 
 
 		 227 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  40.14 
 
 		 210 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  42.54 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  39.42 
 
 		 209 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  36.5 
 
 		 210 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  36.5 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 221 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.83 
 
 		 224 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  35.04 
 
 		 220 aa  87.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 		 215 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  35.34 
 
 		 219 aa  84.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  39.39 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  36.5 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.31 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  32.09 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  34.88 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  34.88 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  34.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  39.71 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  36.8 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  38.19 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  37.59 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  38.97 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.69 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.87 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  32.12 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  38.1 
 
 		 867 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  36.59 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  31.47 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.69 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.86 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.61 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.61 
 
 		 513 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.43 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  34.67 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.71 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.58 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.37 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.97 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.39 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  32.58 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.27 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 636 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 427 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  30.46 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 494 aa  64.7  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  34.45 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  35.62 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  34.65 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  34.43 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1344 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  32.68 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  39.37 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>