160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6177 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  100 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  77.2 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  44.51 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  43.41 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  45.36 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  44.81 
 
 		 229 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  43.41 
 
 		 231 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  44.26 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  41.21 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  37.97 
 
 		 226 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  40.54 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  39.25 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  40.21 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  38.07 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.07 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  37.36 
 
 		 242 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  37.36 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  38.25 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  41.3 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  35.03 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  33.16 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  41.94 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.44 
 
 		 247 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  26.37 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  42.11 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  42.34 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.22 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.26 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.95 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  40.54 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  31.43 
 
 		 416 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  39 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.96 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.72 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  41.89 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  43.75 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  38.61 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  29.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  36 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  37.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.33 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.32 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.72 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  36 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  27.98 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  31.31 
 
 		 378 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.25 
 
 		 845 aa  51.6  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.43 
 
 		 151 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 		 428 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  27.13 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.62 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  24.54 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  27.96 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.13 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.13 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.13 
 
 		 916 aa  48.5  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 120 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.04 
 
 		 158 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.23 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 427 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.3 
 
 		 620 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  31.06 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  34.94 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 863 aa  46.6  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 399 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1274 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 382 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  43.55 
 
 		 431 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.63 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  24.26 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  35.65 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  38.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.92 
 
 		 883 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.19 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.66 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 		 391 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 391 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 391 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>