More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5097 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  100 
 
 
189 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  100 
 
 
189 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  100 
 
 
189 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  40.64 
 
 
191 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  36.92 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.1 
 
 
234 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.23 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.96 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.7 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.25 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.57 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.85 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.78 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.87 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  29.01 
 
 
890 aa  71.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.82 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  28.72 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  37.68 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  29.45 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.05 
 
 
513 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.78 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.21 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.66 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  32.2 
 
 
513 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.8 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.52 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
230 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  31.36 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.17 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.17 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.97 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.06 
 
 
845 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.19 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 
428 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.07 
 
 
423 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
431 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.52 
 
 
426 aa  64.7  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.2 
 
 
877 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  34.19 
 
 
907 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  36 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  27.65 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.51 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.83 
 
 
379 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.21 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  28.57 
 
 
880 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.34 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  25.57 
 
 
242 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.85 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.42 
 
 
348 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.04 
 
 
873 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  33.61 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.91 
 
 
155 aa  61.6  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
149 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  34.68 
 
 
641 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
410 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  31.61 
 
 
874 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  34.96 
 
 
141 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.71 
 
 
427 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
279 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  21.13 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.2 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.93 
 
 
903 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  24.66 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.93 
 
 
903 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  28.25 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.2 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.2 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.93 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
872 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 
377 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.75 
 
 
867 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.09 
 
 
909 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
769 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
877 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
132 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  25.34 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.09 
 
 
903 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
261 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.34 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  25.66 
 
 
511 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.91 
 
 
492 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  24.19 
 
 
242 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  28.08 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>