More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2320 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  72.48 
 
 
149 aa  221  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  67.11 
 
 
149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  67.11 
 
 
149 aa  208  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  65.77 
 
 
149 aa  208  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  62.84 
 
 
149 aa  196  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  55.03 
 
 
150 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  54.42 
 
 
149 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  42.76 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  42.76 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  40.97 
 
 
153 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.49 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 
152 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  39.19 
 
 
148 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.04 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.3 
 
 
152 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  40.28 
 
 
155 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
153 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  36.73 
 
 
154 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
153 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.1 
 
 
153 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.56 
 
 
150 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
149 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 
147 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  33.11 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 
246 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.19 
 
 
160 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  38.1 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  36.73 
 
 
230 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  34.01 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
247 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
241 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  31.51 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  32.68 
 
 
339 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.76 
 
 
249 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
242 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.88 
 
 
231 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
246 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  36.24 
 
 
348 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 
229 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
231 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.76 
 
 
338 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.33 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.45 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  30.61 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.61 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  35.71 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
391 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 
226 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.03 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.67 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
391 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 
410 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.56 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.03 
 
 
242 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.17 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32 
 
 
427 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.77 
 
 
242 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
228 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.87 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
428 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
628 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.47 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  36.3 
 
 
436 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 
236 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
391 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  27.97 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 
625 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
390 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  34.93 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  27.7 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.2 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  28.28 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  37.32 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.87 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.71 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
431 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
232 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 
394 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  28.08 
 
 
141 aa  66.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>