More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0764 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  100 
 
 
605 aa  1211    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.66 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  25.61 
 
 
508 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  25.47 
 
 
484 aa  104  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.22 
 
 
484 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  27.89 
 
 
514 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  26 
 
 
484 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  25.31 
 
 
484 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  27.74 
 
 
481 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  25.37 
 
 
484 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  24.04 
 
 
467 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  27.27 
 
 
482 aa  94.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  27.23 
 
 
478 aa  94.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  28.07 
 
 
503 aa  94  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  25.66 
 
 
513 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.29 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  28.51 
 
 
479 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  24.51 
 
 
480 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  27.67 
 
 
516 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  27.63 
 
 
482 aa  91.3  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  26.2 
 
 
493 aa  90.5  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  26.26 
 
 
472 aa  90.5  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  24.73 
 
 
480 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  26.11 
 
 
480 aa  89.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  24.94 
 
 
484 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  23.69 
 
 
524 aa  88.2  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  28.16 
 
 
485 aa  87.8  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  28.42 
 
 
479 aa  87.4  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  24.94 
 
 
484 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  26.49 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  24.51 
 
 
480 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  27.14 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  25 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  27.3 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  25.46 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.91 
 
 
484 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  26.45 
 
 
499 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  27.27 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1591  cation uptake protein  28.5 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  23.98 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  24.45 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  24.04 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  30.72 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  27.99 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  25.67 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  25.58 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  27.92 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  28.04 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  24.04 
 
 
484 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  25.28 
 
 
481 aa  77  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  25.41 
 
 
485 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  24.54 
 
 
482 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.67 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  28.7 
 
 
149 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.31 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  24.65 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  24.89 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  24.08 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  26.32 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  23.55 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  25.91 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  26.45 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  24.62 
 
 
495 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  26.26 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  26.58 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  24.72 
 
 
481 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  25.73 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  26.44 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  26.03 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  24.68 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  24.95 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  28.68 
 
 
149 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  23.45 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  28.95 
 
 
149 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  22.77 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  23.74 
 
 
485 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  25.24 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  26.23 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  25.17 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
149 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  26.54 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  25.81 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  27.14 
 
 
497 aa  67  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.46 
 
 
188 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 
132 aa  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  24.57 
 
 
484 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  27.21 
 
 
149 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 
150 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.13 
 
 
128 aa  65.1  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.23 
 
 
140 aa  65.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  37.11 
 
 
188 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  24.87 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  23.2 
 
 
485 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  25.36 
 
 
494 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  29.63 
 
 
142 aa  64.7  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  24.45 
 
 
484 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  24.59 
 
 
485 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36.28 
 
 
139 aa  63.9  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  29.32 
 
 
153 aa  63.9  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>